ในปี พ.ศ.2390 มีคริสตชนประมาณ 200 คน ได้ช่วยกันสร้างวัดขึ้นในที่ดินของ ฟรังซิสโก ไง้ เป็นเรือนไม้หลังคามุงจาก มีชื่อว่า "วัดศาลาแดง" หริอบางคนเรียกว่า "วัดรางยาว" ตามลักษณะของสีทาวัดและทำเลที่ตั้ง อยู่ริมคลองที่ชาวจีนขุดต่อกับแม่น้ำแม่กลองเพื่อนำน้ำมาทำสวนผัก ต่อมาได้ย้ายมาอยู่ที่ปากคลองบางนกแขวก ที่พระบาทสมเด็จพระจอมเกล้าเจ้าอยู่หัว รัชกาลที่ 4 ทรงสั่งขุดเชื่อมระหว่างแม่น้ำแม่กลองกับแม่น้ำท่าจีน เป็นเส้นทางคมนาคมทางน้ำมุ่งไปสู่กรุงเทพฯ และได้สร้างวัดหลังใหม่ที่นั่น โดยมีชื่อว่า "แม่พระบังเกิด"

         ปี พ.ศ. 2433 บาทหลวงเปาโลซัลมอน หรือที่ชาวบ้านเรียกท่านว่า "คุณพ่อเป่า" ได้เริ่มลงมือสร้างวัดหลังนี้ให้เป็นรูปเป็นร่างขึ้น โดยได้รับทุนสนับสนุนจากญาติพี่น้องของท่านในฝรั่งเศส จากคณะมิสซังต่างประเทศแห่งกรุงปรารีส จากกรุงโรม หาทุนในการสร้างจนแล้วเสร็จ ทำพิธีเสกและเปิดใช้อย่างเป็นทางการ ในวันที่ 11 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2439 ส่วนวัสดุของวัดหลังเก่าได้ถูกนำไปสร้างไว้ที่คลองขวางล่าง โดยมีนามชื่อว่า "วัดพระแม่องค์อุปถัมภ์" หรือที่ชาวบ้านเรียกว่า "วัดใน"

         ต่อมาในปี พ.ศ. 2537 สังฆมณฑลราชบุรี ได้ทำการบูรณะซ่อมแซมวัดครั้งใหญ่ เพื่อฉลองครบ 100 ปี ในปี 2539 ดังนั้นอาสนวิหารแห่งนี้ จึงเป็นวัดที่สวยงามและเก่าแก่ที่สุดในประเทศไทย

สิ่งที่น่าสนใจ

อาสนวิหารแม่พระบังเกิดบางนกแขวก เป็นสถาปัตยกรรมแบบโกธิค คือรูปแบบการก่อสร้างจึงมีโครงสร้างสูง ที่ยอดเป็นหอสูงแหลมอยู่ข้างบน ( ใช้เป็นหอระฆัง ) ทำให้รูปร่างสูงระหงขึ้นสู่ฟ้า เพดาน ซุ้มประตูหน้าต่าง และซุ้มภายในมีส่วนโค้งที่แปลกกว่าส่วนโค้งของศิลปะอื่นใด คือเป็นส่วนโค้งที่มีจุดตัดอยู่บนสุด รูปแบบภายนอกของอาสนวิหารได้สัดส่วนสวยงามมากที่สุดในประเทศไทย

ภายในอาสนวิหารมีสิ่งหนึ่งที่เด่นหาดูยากและสวยงามที่สุดในประเทศไทยเช่นกัน นั่นก็คือ กระจกสี ตามช่องซุ้มประตูและหน้าต่างเป็นภาพรวมกันอยู่ภายในกรอบ เมื่อพิจารณาภาพจากช่องที่มีแสงสว่างผ่าน ดูคล้ายกับภาพนั้นเขียนด้วยแก้วสี ภาพจากการประดับกระจกสี แบ่งออกเป็น 2 ส่วน

ส่วนที่ 1 อยู่ในกรอบกลมด้านบนผนังอาสนวิหาร เป็นประวัติของแม่พระหรือพระนางมารีอา ( พระมารดาของพระเยซูเจ้า ศาสดาของศาสนาคริสต์ ) ตั้งแต่ประสูติจนสิ้นพระชนม์ และได้พระรับเกียรติยกขึ้นสู่สวรรค์

ส่วนที่ 2 อยู่เหนือซุ้มประตูหน้าต่าง เป็นรูปนักบุญต่างๆ ทั้งชายและหญิงตามหลักความเชื่อทางศาสนาคริสต์นิกายโรมันคาทอลิก ทุกคนเมื่อเกิดมาจะต้องรับศีลล้างบาป เพื่อเข้าเป็นสมาชิกของศาสนา และมีนักบุญเป็นองค์อุปภัมถ์คุ้มครองของแต่ละคน ผู้ชายก็ต้องเลือกนักบุญที่เป็นชาย เช่น โจเซฟ สมชาย คริสโตเฟอร์ แจ่ม ส่วนผู้หญิงต้องเลือกนักบุญที่เป็นหญิง เช่น เทเรซา ผ่องศรี มารีอา มาลัย เป็นต้น